De overname werd eerder uitgesteld vanwege technische onvolkomenheden aan de voortstuwing. Defensie heeft dit tweede amfibisch transportschip voor het Commando Zeestrijdkrachten inmiddels gereed bevonden. Wel blijven delen van het voortstuwingssysteem voorlopig buiten de formele overname. Als deze gedurende een bepaalde periode storingsvrij functioneren, neemt Defensie het schip ook op deze punten over.
Het LPD-2 is volgens planning bezig aan het proeftochtjaar. De Johan de Witt komt vermoedelijk nog dit najaar in dienst bij het Commando Zeestrijdkrachten. Dan volgt een gereedstellingstraject van ongeveer zes maanden. Daarna is het schip operationeel inzetbaar voor de NATO Response Force (NRF-12) begin 2009.